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Whole genome sequencing of bacterial genomes - tools and applications(으)로 돌아가기

덴마크 기술 대학교 (DTU)의 Whole genome sequencing of bacterial genomes - tools and applications 학습자 리뷰 및 피드백

4.6
별점
1,249개의 평가

강좌 소개

This course will cover the topic of Whole genome sequencing (WGS) of bacterial genomes which is becoming more and more relevant for the medical sector. WGS technology and applications are high on international political agenda, as the classical methods are being replaced by WGS technology and therefore bioinformatic tools are extremely important for allowing the people working in this sector to be able to analyze the data and obtain results that can be interpreted and used for different purposes. The course will give the learners a basis to understand and be acquainted with WGS applications in surveillance of bacteria including species identification, typing and characterization of antimicrobial resistance and virulence traits as well as plasmid characterization. It will also give the opportunity to learners to learn about online tools and what they can be used for through demonstrations on how to use some of these tools and exercises to be solved by learners with use of freely available WGS analysis tools . By the end of this course you should be able to: 1. Describe the general Principles in typing of Bacteria 2. Give examples of the applications of Whole Genome Sequencing to Surveillance of bacterial pathogens and antimicrobial resistance 3. Apply genomic tools for sub-typing and surveillance 4. Define the concept of Next-Generation Sequencing and describe the sequencing data from NGS 5. Describe how to do de novo assembly from raw reads to contigs 6. Enumerate the methods behind the tools for species identification, MLST typing and resistance gene detection 7. Apply the tools for species identification, MLST typing and resistance gene detection in real cases of other bacterial and pathogen genomes. 8. Describe the methods behind the tools for Salmonella and E.coli typing, plasmid replicon detection and plasmid typing 9. Utilize the tools for Salmonella and E.coli typing, plasmid replicon detection and plasmid typing in real cases of other bacterial and pathogen genomes. 10. Explain the concept and be able to use the integrated bacterial analysis pipeline for batch analysis and typing of genomic data 11. Demonstrate how to construct phylogenetic tree based on SNPs 12. Apply the phylogenetic tool to construct phylogenetic trees and explain the relatedness of bacterial or pathogen strains 13. Describe how to create your own sequence database 14. Utilize the MyDbFinder tool to detect genetic markers of interest from whole genome sequencing...

최상위 리뷰

AP

2020년 7월 19일

Thank you very much for this course through which i learnt basic handling of bioinformatics tools and concepts of WGS. This will help me a lot while pursuing my PhD research work in my field.

MB

2019년 6월 9일

Excellent course with a wealth of information about tools and applications of whole genome sequencing. Presented in a very lucid and interesting manner, very crispy and simplified course.

필터링 기준:

Whole genome sequencing of bacterial genomes - tools and applications의 334개 리뷰 중 1~25

교육 기관: Robert F

2019년 1월 28일

교육 기관: Sören W

2019년 1월 7일

교육 기관: shilpa y

2020년 2월 19일

교육 기관: Douglas A H

2017년 12월 28일

교육 기관: Marwa M M B

2017년 8월 19일

교육 기관: Krishnanathan K

2021년 10월 28일

교육 기관: Faizan A

2020년 4월 3일

교육 기관: Dr. B E S

2020년 4월 24일

교육 기관: Kazi M Z R

2020년 8월 23일

교육 기관: Anbazhagan P

2020년 7월 20일

교육 기관: Pham T T T

2017년 9월 17일

교육 기관: WK S

2020년 5월 29일

교육 기관: Sbl Z

2019년 8월 15일

교육 기관: Sneha S

2020년 8월 28일

교육 기관: Varun C

2020년 1월 2일

교육 기관: Mirza M V B

2019년 6월 10일

교육 기관: Агапов А П

2022년 5월 8일

교육 기관: Gourab D

2017년 8월 20일

교육 기관: Kira K

2018년 12월 4일

교육 기관: magombe a

2021년 5월 6일

교육 기관: Dr. K M K

2020년 6월 26일

교육 기관: Jerusha S

2021년 6월 14일

교육 기관: Xiangyang L

2019년 6월 30일

교육 기관: Claudia M d l P

2019년 8월 27일

교육 기관: Erica Y

2018년 9월 30일